Index

C

clusters_from_file() (in module crystal_torture.pymatgen_interface) clusters_from_structure() (in module crystal_torture.pymatgen_interface) count_sites() (in module crystal_torture.pymatgen_doping) create_halo() (in module crystal_torture.pymatgen_interface)

crystal_torture.pymatgen_doping module crystal_torture.pymatgen_interface module

D

dope_structure() (in module crystal_torture.pymatgen_doping)

dope_structure_by_no() (in module crystal_torture.pymatgen_doping)

F

filter_structure_by_species() (in module crystal_torture.pymatgen_interface)

G

get_all_neighbors_and_image() (in module crystal_torture.pymatgen_interface)

graph_from_file() (in module crystal_torture.pymatgen_interface) graph_from_structure() (in module crystal_torture.pymatgen_interface)

I

index_sites() (in module crystal_torture.pymatgen_doping)

M

map_index() (in module crystal_torture.pymatgen_interface) module crystal_torture.pymatgen_doping crystal_torture.pymatgen_interface

N

nodes_from_structure() (in module crystal_torture.pymatgen_interface)

S

set_fort_nodes() (in module crystal_torture.pymatgen_interface)

set_site_labels() (in module crystal_torture.pymatgen_doping) sort_structure() (in module crystal_torture.pymatgen_doping)